La comisión directiva actual del Club Estudiantes de Mercedes está compuesta de la siguiente manera. La misma se renueva por voto directo de los socios de la entidad.
Presidente: Abel Defino.
Vicepresidente: Néstor Palacios.
Secretario: Jorge Siri.
Prosecretario: Juan Parisso.
Tesorero: Pablo Luna.
Protesorero: Agustín Gerardi.
Primer Vocal: Jerónimo Luna.
Segundo Vocal: Agustín Duran.
Tercer Vocal: Franco Mandaglio.
Cuarto Vocal: Claudio Rojas.
Primer Vocal suplente: Ciro Rebagliati.
Segundo Vocal suplente: Miguel López.
Tercer Vocal suplente: Héctor Mosquera.
Cuarto Vocal suplente: Nicolás Dinova.
Revisores de cuentas titulares: Florencia Conte, Silvio Erramuspe y Roberto Araya.
Revisores de cuentas suplentes: Agustín Lazbal Cervera y Lara Torres Neimann.